El municipio de Mocoa cuenta con los siguientes límites.
Por el Norte:
Con los departamentos del Cauca (Municipio de Santa Rosa) y
Nariño (Municipio del Tablón), arrancando desde
las cabeceras del río Cascabel, por este aguas abajo
hasta su desembocadura sobre el río Caquetá, continuando
por este a la desembocadura del río Villalobos.
Por el Oriente:
Limita con el departamento del Cauca (Municipios de Santa Rosa
y Piamonte) y el municipio de Puerto Guzmán, partiendo
desde el punto anterior, continuando aguas abajo del río
Caquetá hasta la desembocadura de la quebrada Sardinas,
desde el punto en línea recta imaginaria hasta encontrar
el Nacimientodel río Jauno, continua con rumbo sur oriente
en línea recta imaginaria hasta encontrar el nacimiento
de la quebrada Júpiter de este punto aguas abajo hasta
la desembocadura en el río Caimán, sigue hacia
abajo hasta la intersección de la línea imaginaria
en los límites con el Municipio de Puerto caicedo.
Por el Sur:
Limita con el Municipio de Puerto Caicedo y va del punto anterior
con rumbo oeste hasta encontrar el cauce del río Picudo,
por este aguas arriba hasta su nacimiento, desde este punto
en línea norte hasta encontrar en el río Mocoa,
por el río Mocoa aguas arriba hasta la desembocadura
de la quebrada Sangoyaco, por este aguas arriba hasta su nacimiento,
desde este punto en línea recta imaginaria hasta el nacimiento
de la quebrada Yuruyaco, por estas aguas abajo hasta la desembocadura
en el río Putumayo, por este aguas arriba hasta la desembocadura
del río blanco.
Por el Occidente:
Desde la desembocadura del río Blanco al río
Putumayo, se toma aguas arriba del río Blanco hasta la
desembocadura de la quebrada Cristales, por este hasta su nacimiento,
de este punto en línea imaginaria con rumbo noroeste
hasta el nacimiento de la quebrada Tortuga, por estas aguas
abajo hasta su desembocadura sobre el río Mocoa, desde
este punto aguas arriba hasta la desembocadura del río
Titango, por este aguas arriba hasta su nacimiento y de este
punto en línea recta imaginaria, con rumbo noroeste,
hasta encontrar las cabeceras del río Cascabel.